大脑中的杏仁核组织在情绪管理中发挥着关键作用，是产生情绪、情绪识别和调节情绪的脑部重要组织。杏仁核位于大脑颞叶内侧，在海马体的前端。它处在边缘系统中，左右脑各有一个，形状大致呈杏仁状，这也是杏仁核名字的由来。
当杏仁核面对威胁或者特殊情况时，杏仁核会快速反应，让人产生恐惧、焦虑等情绪，比如看到一个人疯狂的向自己冲过来，杏仁核会马上被激活，触发恐惧情绪，让人做出躲避动作。杏仁核还参与情绪记忆，像经历过的创伤事件，杏仁核会存储与之相关的情绪记忆，在相似场景下会唤起这种情绪。同时杏仁核会与大脑其他区域相互协作来调节情绪。它和前额叶皮质有紧密连接，前额叶皮质可以对杏仁核产生的情绪进行调节和控制，抑制杏仁核过度的情绪反应。
除杏仁核外，前额叶皮质也与情绪管理密切相关。它主要负责调节和控制情绪，能抑制杏仁核产生的冲动情绪，让人做出理性反应。例如在面对特殊情况时，前额叶皮质会发挥作用，避免过激的情绪反应。另外，海马体也对情绪管理有作用，它主要参与情绪记忆的巩固和提取。当回忆起过去的情绪事件时，海马体就会参与其中。
通过实验发现，特定频率的脑电波刺激对调节杏仁核功能失调具有辅助作用。大脑神经元通过电活动来传递信息，脑电波就是这些电活动的综合体现。当使用特定频率的脑电波刺激时，特定频率的刺激能够诱导神经元的可塑性变化。就像对神经网络进行重新“编程”，这种刺激可以调节杏仁核与前额叶皮质之间的连接强度和神经递质的释放。从神经递质系统来讲，脑电波刺激会影响神经递质的代谢。它可以调节杏仁核中如谷氨酸、氨基丁酸等神经递质的水平。氨基丁酸是一种主要的抑制性神经递质，特定频率刺激会增加杏仁核中氨基丁酸的释放，从而抑制杏仁核的过度活跃，改善情绪的调节功能。